Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf2Q7TMI3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf2Q7TMI3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uhrf2Q7TMI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms