Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyfip1Q7TMB8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyfip1Q7TMB8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyfip1Q7TMB8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyfip1Q7TMB8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyfip1Q7TMB8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyfip1Q7TMB8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyfip1Q7TMB8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyfip1Q7TMB8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyfip1Q7TMB8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyfip1Q7TMB8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms