Protein–RNA interactions for Protein: Q7M760

Zranb1, Ubiquitin thioesterase Zranb1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb1Q7M760 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb1Q7M760 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb1Q7M760 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb1Q7M760 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb1Q7M760 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb1Q7M760 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb1Q7M760 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb1Q7M760 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb1Q7M760 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zranb1Q7M760 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb1Q7M760 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zranb1Q7M760 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms