Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd2Q7JJ13 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd2Q7JJ13 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd2Q7JJ13 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms