Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim12Q78RX3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim12Q78RX3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim12Q78RX3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms