Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms