Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Topbp1Q6ZQF0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Topbp1Q6ZQF0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms