Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp34Q6ZQ93 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp34Q6ZQ93 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms