Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy1Q6ZQ11 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy1Q6ZQ11 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chsy1Q6ZQ11 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms