Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h4Q6ZPZ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h4Q6ZPZ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms