Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnt1Q6ZPR4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnt1Q6ZPR4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnt1Q6ZPR4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnt1Q6ZPR4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnt1Q6ZPR4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnt1Q6ZPR4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnt1Q6ZPR4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnt1Q6ZPR4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnt1Q6ZPR4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnt1Q6ZPR4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms