Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tfap2eQ6VUP9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2eQ6VUP9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms