Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc154Q6RUT8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc154Q6RUT8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc154Q6RUT8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc154Q6RUT8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms