Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt9Q6RHW0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt9Q6RHW0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt9Q6RHW0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms