Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tcaf3Q6QR59 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf3Q6QR59 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf3Q6QR59 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Tcaf3Q6QR59 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcaf3Q6QR59 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Tcaf3Q6QR59 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf3Q6QR59 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcaf3Q6QR59 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Tcaf3Q6QR59 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Tcaf3Q6QR59 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms