Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2b4Q6Q477 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b4Q6Q477 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b4Q6Q477 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms