Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU9

Uncharacterized protein FLJ45252 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PIU9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PIU9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PIU9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PIU9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PIU9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PIU9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms