Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad54bQ6PFE3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54bQ6PFE3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54bQ6PFE3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms