Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcc2Q6PDG5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcc2Q6PDG5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcc2Q6PDG5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms