Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd13aQ6PDE8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms