Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkab2Q6PAM0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prkab2Q6PAM0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms