Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ3

Garem2, GRB2-associated and regulator of MAPK protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem2Q6PAJ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Garem2Q6PAJ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Garem2Q6PAJ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Garem2Q6PAJ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garem2Q6PAJ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Garem2Q6PAJ3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Garem2Q6PAJ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Garem2Q6PAJ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Garem2Q6PAJ3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Garem2Q6PAJ3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Garem2Q6PAJ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Garem2Q6PAJ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Garem2Q6PAJ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Garem2Q6PAJ3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms