Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd3Q6P9Z1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd3Q6P9Z1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms