Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slf2Q6P9P0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slf2Q6P9P0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slf2Q6P9P0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms