Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg2aQ6P4T0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg2aQ6P4T0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg2aQ6P4T0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms