Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp4r3aQ6P2K6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms