Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pprc1Q6NZN1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pprc1Q6NZN1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pprc1Q6NZN1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pprc1Q6NZN1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms