Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc3bQ6NWW9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3bQ6NWW9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3bQ6NWW9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3bQ6NWW9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms