Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt2Q6NVG7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Colgalt2Q6NVG7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colgalt2Q6NVG7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms