Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SphkapQ6NSW3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SphkapQ6NSW3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.41
SphkapQ6NSW3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SphkapQ6NSW3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms