Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4galnt3Q6L8S8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4galnt3Q6L8S8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4galnt3Q6L8S8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms