Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arhgap20Q6IFT4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms