Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6DFW0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q6DFW0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q6DFW0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms