Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ltn1Q6A009 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltn1Q6A009 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ltn1Q6A009 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltn1Q6A009 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms