Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2cQ69ZS6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2cQ69ZS6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2cQ69ZS6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sv2cQ69ZS6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2cQ69ZS6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2cQ69ZS6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2cQ69ZS6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2cQ69ZS6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms