Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzrn3Q69ZS0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzrn3Q69ZS0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzrn3Q69ZS0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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