Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp4Q68FH0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp4Q68FH0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp4Q68FH0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp4Q68FH0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp4Q68FH0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp4Q68FH0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp4Q68FH0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp4Q68FH0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms