Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kiaa1549Q68FD9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kiaa1549Q68FD9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms