Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rab3ipQ68EF0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab3ipQ68EF0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms