Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Papd5Q68ED3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd5Q68ED3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Papd5Q68ED3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms