Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp2a3Q64518 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a3Q64518 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms