Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja3Q64448 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gja3Q64448 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja3Q64448 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms