Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc18Q640L5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc18Q640L5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc18Q640L5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
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