Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CochQ62507 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CochQ62507 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CochQ62507 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CochQ62507 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CochQ62507 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CochQ62507 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CochQ62507 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CochQ62507 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CochQ62507 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CochQ62507 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CochQ62507 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CochQ62507 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CochQ62507 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CochQ62507 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CochQ62507 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CochQ62507 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CochQ62507 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CochQ62507 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CochQ62507 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CochQ62507 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CochQ62507 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CochQ62507 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CochQ62507 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CochQ62507 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CochQ62507 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CochQ62507 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CochQ62507 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CochQ62507 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CochQ62507 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CochQ62507 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CochQ62507 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CochQ62507 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CochQ62507 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CochQ62507 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CochQ62507 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CochQ62507 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CochQ62507 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CochQ62507 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms