Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga3Q62470 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Itga3Q62470 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms