Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vat1Q62465 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms