Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sp4Q62445 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sp4Q62445 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sp4Q62445 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms