Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms