Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf6Q62311 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf6Q62311 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms