Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn9aQ62205 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn9aQ62205 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scn9aQ62205 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms